香港新闻日报通讯社据台湾《中国时报》报道，马英九11日接见来台谈判并签署“台日渔业协议”的“日本交流协会”会长大桥光夫，大力肯定“台日渔业协议”为“历史性的任务”。针对协议中特别纳入搁置主权争议的“免责条款”，马英九说，台日对协议所做的所有决定，都不影响双方在此议题上的其他主张，虽然此次没有机会讨论钓鱼岛主权问题，“以后有机会再来讨论”。

台日于周三举行第17次渔业会谈，大桥光夫代表日方，与台湾“亚东关系协会”会长廖了以签署“台日渔业协议”，划设双方渔民在钓鱼岛海域的作业范围。马英九对此表示欣慰，认为双方在谈判17年之后达成宝贵共识，是“一个历史性任务的完成”。

报道称，对台日在协议中以“免责条款”搁置双方的主权争议，马英九特别表示，这次谈判虽然未在主权议题上取得进展，但在渔权问题上却不小进展，代表台湾一方面坚持主权主张，也愿意在共同开发资源的情况下，以和平方式解决争议。

他也强调，协议中清楚载明，台日对此做决定均不会影响双方在此议题上的其他主张，这次双方虽没有机会讨论钓鱼岛主权问题，“以后有机会再来讨论”。

马英九认为，此一作法不但符合国际法与联合国宪章，也与他去年提出的“东海和平倡议”受到日本重视有很大关系;此次双方同意暂时搁置争议，专心讨论有关渔业、渔场的问题，台湾各地渔民都能实质受惠。

针对中国大陆渔船可否进入双方协议海域捕鱼，台“农委会渔业署”副署长蔡日耀11日在台“立法院”经济委员会答询表示，该协议仅适用于台日之间的渔船，过去也主要是台湾渔船在该海域作业，“中、日渔船都非常少”。